真空度下降是常見故障。對于上海安亭科學儀器廠生產的高速、超速離心機，大部分都設有真空裝置，目的是讓離心腔在運行狀態時處于中或高真空狀態，減少對轉頭的摩擦，使其穩定運行。在真空度下降或抽真空不好時，要檢查上海安亭離心機真空系統，般是將油更換，真空度就會恢復。另外，小型或臺式離心機，人們常會忘記將放在離心腔中的轉頭取出，時間長了轉頭會卡死在軸上。不能用力敲打，這樣會損壞離心軸，導致轉軸扭歪，會損壞離心機，甚至發生事故。必要時，可以請專業工程師協助取出。高速、超速離心機運行過程中，面板上有故障提示，可以針對相應的故障提示符處理故障。